В отличие от высших споровых растений (мхов, папоротников и др.), которые размножаются спорами, голосеменные растения размножаются семенами. Кроме голосеменных, также семенами размножаются покрытосеменные растения. Однако в отличие от голосеменных, у покрытосеменных образуется цветок и плод, а семена находятся в плоде. У голосеменных цветка и плода не образуется, а семена лежат открыто на чешуйках. Поэтому их и называют «голосеменные».