По крайней мере, есть две причины :
1.В Красное море не впадает ни одна река,а только во время редких дождей оно пополняется пресной водой , в отличие от Балтийского , которое пополняется пресной водой из массы , трудно сосчитать, рек и речек, а также за счёт много большего по сравнению с Красным количества осадков;
2.Даже при одинаковой исходной солёности за счёт много большей температуры окружающего воздуха испарение с поверхности Красного моря много больше , чем Балтийского и , соответственно, концентрация солей в нем выше,
а выравнивание солёности из-за их взаимной удалённости не происходит.